Irgendwie hast du da doppelte Installationen in verschiedenen Verzeichnissen. Ich würde den guten alten Holzhammer bemühen und mal von oben draufkloppen, und zwar so:
sudo mv /usr/lib/node_modules /tmp
Dann die Homebridge restarten mit
sudo systemctl restart homebridge; sudo journalctl -fau homebridge und das Log beobachten, ob es Probleme gibt. Gibt es die, dann ist der Holzhammer nicht filigran genug und du musst deine Änderungen rückgängig machen mit:
sudo mv /tmp/node_modules /usr/lib und die Homebridge erneut restarten.
Gibt es keine Probleme und die Fehler sind auch weg, dann räumst du (irgendwann, morgen, übermorgen, am Wochenende) noch auf mit
rm -rf /tmp/node_modules (aber nur, wenn es keine Probleme gibt!)