Hm, der Beitrag liest sich für mich inzwischen etwas diffus. Kannst du bitte nochmal zusammenfassen, was alles nicht funktioniert und am besten dabei auch gleich mal dein Setup auflisten? 
Da du ja offenbar eher ein Einzelfall bist mit deinem Problem, könnte ich mir vorstellen, dass es doch noch eine Lösung gibt. 
Hast Du zufällig noch ein altes iPad / iPhone mit iOS 9-irgendwas in der Cloud?
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Und im Menü der ATVs, wird HomeKit da als verbunden angezeigt?
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Bist Du schon auf 13.1.3?
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Noch Fragen zum Setup:
- Welchen Router benutzt du?
- Welche Geräte spielen als Clients mit (iPhone, iPad etc. inkl. aller Gästegeräte)
- iOS-Versionen sämtlicher "Mitspieler" sind auf aktuellem Stand?
Als erstes würde ich persönlich genau 1 ATV über LAN direkt mit dem Router verbinden (ohne Switch), um herauszufinden, ob die Verbindung damit immer noch abbricht. Wenn dem so ist, Austausch des einen ATV gegen das andere…
Es geht ja erstmal darum festzustellen, ob die Steuerzentralenverbindung über LAN dauerhaft hält. Dabei können diverse EVE-Geräte zur Not erstmal getrennt bleiben. Dafür kannst du das ATV versuchsweise mit kurzem Kabel vorübergehend direkt mit dem Router verbinden. Wenn es darüber klappt, hast du schonmal eine saubere Fehlereingrenzung, in dem Fall ist die WLAN-Verbindung unzuverlässig.
Hast du eine SSID für beide Frequenzen (2,4/5GHz) oder zwei separate SSIDs pro Frequenz?
Da könnte es evtl. schon mit den Problemen anfangen. Deswegen nochmal: Teste am besten das LAN. Zur Not kaufst/leihst du dir ein langes Zuleitungskabel.
FritzOS 7.12?
Dann würde ich schonmal bei der Fritzbox mit einem Firmware-Update beginnen.
