Wenn ich mich recht erinnere werden bei der Matter Umstellung ja alle Geräte neu in HomeKit angelegt.
Du hast auch geschrieben, dass dir Controller 80 ungültige Automationen angezeigt hat. Da würde ich nochmal ansetzen.
Jeder einzelne noch Automation nochmals checken, ob jeder Auslöser stimmt, jede Bedingung, jede Aktion … auch innerhalb möglicher Kurzbefehle.
Oder wenn es hart auf hart kommt, alle Automationen löschen und neu aufsetzen.
Musste ich aus anderen Gründen auch schon mal machen, was mich tierisch geärgert hatte.
Letztendlich war ich aber auch froh, weil am Ende ganz viel Quatsch rausgeflogen ist oder vereinfacht werden konnte